A股现行的是T+1交易制度，且有涨跌幅限制；而
港股现行的则是在当天交易时段内可以自由买卖的，交易次数及涨跌幅均无限制的T+0交易制度。
在股票买卖过程当中，A股的每手统一实行100股为一个交易单位，而港股的每手交易单位，主要是根据股票的价格来定，并没有统一的规定，大致设有400股、500股、1000股、2000股、10000股/手不等。这也是有些投资者经常遇到未能全仓买入或出现买入股数不准确而被取消交易的主要原因。
另外，值得注意的是，A股投资者买卖股票，证券公司可免费提供行情软件；而香港市场，行情软件是需要单独向投资者收取费用的。
交收制度及资金的存取区别
目前，A股实行的是T+1交收制度，在资金管理方面，由银行进行第三方托管；港股市场现行为T+2交收制度，在股票卖出后，向开户行提交提款申请后，需第2个工作日才能进行资金转取，资金托管实行第三方托管，常见的由汇丰银行、恒生银行、中国银行(香港)、渣打及廖创兴银行等，客户提取资金或股票转托管需要填写证券公司专用表格，并签字经法务部核实才可转取。因此，投资者开户签字样式是很重要的，它是资金存取的法律依据。
交易品种的区别
A股市场现存的交易品种，主要是以股票、基金为主，同时还有部分权证、可转债等品种；而港股市场上的交易品种众多，除股票、股指期货、基金、窝轮之外，还拥有如高息票据、股票沽空、期权、股票挂钩票据等各种衍生工具，并可实行保证金账户(透支)买卖。
投资理念的区别
这应该是两个市场差别最大的地方。尽管近年来A股市场发生翻天覆地的变革，积极吸取国外的经验，价值投资的呼声越来越高，但在投资理念上缺乏一定的理性思维，仍未摆脱政策市及消息市的阴影，大多数投资者仍旧崇尚的是政策与消息面主导股市，很少关注境外市场的变化。
而港股市场属于国际化市场，海外基金以及市场游资介入较多，与全球经济及金融市场紧密相连，除本地因素之外，多数时候还需“眼观六路，耳听八方”，参考其他地区股市的变化。因此，投资者相对较为理性，主要着重于基本面分析。
事实上，比较一下A股与港股两地股票普遍涨幅就可以说明一点。港股经历5年牛市行情，多数股份累计涨幅可能还不到8倍；但A股短短2-3年行情，多数股票涨幅均达到8倍以上。这也是多数香港人士感叹，现在内地股市投资收益是用“倍”来计算，而香港市场只能用百分比来计算。
还要重点提到的是，关于投资A股与港股究竟哪个市场风险更大的问题。前期，部分市场人士单从“是否有涨跌幅限制”的角度，来判断投资港股存在巨大风险，显然是片面的。熟悉港股市场的人都知道，我们经常用蓝筹、红筹、国企股、细价股来区分股票或者上市公司的实力，犹如国内股市用绩优股、ST股份一样。大多数情况下，这些一、二线股票每天的波动幅度不会超过正负3%，波动并不大，诸如A股市场经常出现的连续拉涨停或跌停的情况并不多见，只有极少数三线或细价股才会出现较大波动，但市场均会有风险提示的消息。若真的要拿细价股作文章，A股的ST股份何尝不是如此，即使有涨跌停限制，照样我行我素。